Evolusi adalah suatu perubahan pada makhluk hidup yang terjadi secara perlahan dalam jangka waktu yang sangat lama sehingga terbentuk spesies baru. Terdapat beberapa bukti atau petunjuk terjadinya evolusi.
Anatomi perbandingan terbagi menjadi 2 yaitu perbandingan analogi dan perbandingan homologi. Anatomi perbandingan analogi adalah dua organ yang mempunyai bentuk dasar yang sangat berbeda, tetapi akibat peristiwa evolusi konvergen menjadikan organ tersebut mempunyai fungsi yang sama.
Contohnya pada sayap burung-burung dan sayap kupu-kupu. Keduanya memiliki struktur yang berbeda tetapi mempunyai fungsi yang sama yaitu untuk terbang.
Anatomi perbandingan homologi adalah dua organ yang mempunyai bentuk dan fungsi yang berbeda. tetapi, kedua organ tersebut memiliki bentuk dasar yang sama. Contohnya, tangan manusia dan kelelawar, strukturnya sama tetapi fungsinya berbeda. Tangan manusia memegang, tangan kelelawar untuk untuk terbang.
Organ vestigial yaitu sebagai organ yang tersisa dari suatu organ yang telah tereduksi karena dianggap tidak terpakai lagi. Beberapa contoh organ yang dianggap sebagai organ vestigial antara lain :
Palaentologi atau ilmu fosil membuktikan adanya makhluk hidup yang ada pada zaman purba. Potongan-potongan fosil disatukan kemudian direkonstruksi ulang sehingga dapat dibayangkan bentuk morfologi utuhnya dan di bandingkan dengan makhluk hidup yang hidup di zaman sekarang.